Una dintre cele mai cunoscute lucrări ale lui El Greco pictează ulterior „Pogorârea Duhului Sfânt”. O compoziție dinamică se desfășoară de jos în sus, ceea ce este tipic pentru perioada târzie a operei lui El Greco.
O notă deosebită este tipul mișcării sacadate caracteristice târziu El Greco, ca și cum ar fi o sarcină ratată a curentului electric; structura imaginii se bazează pe o comparație între mișcare și rigiditate, amorțeală și spiritualitate, infinit și izolare. Cu toate acestea, imaginea exterioară spectaculoasă este vopsită ca și cum ar fi o inimă rece și nu face o impresie puternică.
El Greco nu se abate de la reprezentarea tradițională a poveștii evanghelice a descendenței Duhului Sfânt. În mod tradițional, Duhul Sfânt este descris ca un porumbel. Locul central al compoziției este ocupat de Maria, ridicând cu reverență ochii în sus, înconjurat de alți discipoli ai lui Hristos. Într-o încăpere îngustă, întunecată într-un cerc strâmt, în întristare și persecuție, au rămas fideli poruncii Domnului „de a nu părăsi Ierusalimul”, unde aveau cel mai mult risc de cei care și-au răstignit Stăpânul. Dar cea mai mare minune s-a întâmplat – puterea Duhului Sfânt s-a sprijinit pe fiecare dintre ele, apărând sub formă de limbi aprinse.
Presupunem că cel de-al doilea apostol din dreapta este un autoportret al lui El Greco. Aceeași persoană apare pe fundal în tabloul „Betrothal of the Virgin”, probabil ultima lucrare a maestrului.
Există, de asemenea, o presupunere că tabloul „Pogorârea Duhului Sfânt” a fost modificat de un alt artist, poate Jorge Manuel, fiul lui El Greco.