Pânza uriașă, alungită „Botezul lui Hristos” este singura pictură despre care se știe cu încredere că a aparținut ciclului altarului pictat de El Greco pentru școala agustinienilor înstăriți din Madrid, fondată de doamna curte nobilă Maria d’Aragon. Această imagine conține multe caracteristici ale operei artistului din a doua jumătate a anilor 1590.
Tabloul „Botezul lui Hristos”, ca și alte lucrări din această perioadă, amplasate în afara Spaniei, oferă privitorului impresia de orbire, imbufnată de o dispoziție de bucurie luminată de vedere. Imaginea se desfășoară în sus, proporțiile figurilor sunt alungite, totul este învăluit într-o mișcare puternică, evenimentul are loc într-o altă lume fantastică, unde granițele dintre cele pământești și cele cerești sunt șterse.
Poate, printre celelalte tablouri din această perioadă, „Botezul lui Hristos” este cel mai mult marcat de un personaj mistic. Hristosul blând și ascetul Ioan Botezătorul, al cărui corp muscular este modelat cu o libertate picturală sigură, sunt cele mai calme, stabile imagini ale imaginii.
Mediul lor întruchipează emanația divină vărsată aici. Artistul încearcă să crească puterea impresiei generale cu luminozitatea culorii, figurile supraîncărcate și tensiunea pitorească, care, potrivit lui X. Camon Aznar, nu lasă o „pauză pentru odihnă”. Suprafața colorată a pânzei, pătrunsă de sclipiri de lumină și parcă prinsă de uimire interioară, devine un fel de materie spiritualizată independentă.
El Greco percepe aici mișcarea nu atât ca mișcarea fizică a corpurilor în spațiu, ci ca apariția, formarea și dispariția. Unul se transformă în altul, se dizolvă în strălucirea culorilor, se stinge și se luminează, fețele îngerilor cad înapoi, își pierd forma, buclele lor se transformă în halo auriu, hainele fosforesce cu o flacără albăstrui și verde, aripi transparente argintii flutură precum aripile libelule. Un rol imens în transmiterea unei astfel de mișcări îl joacă o linie de contur ondulată.
Expresivitatea liniei, sensul special al conturului este tradiția orientală, bizantină în opera maestrului. Cu toate acestea, ea a regândit-o în felul său. El Greco folosește un sistem de ritm liniar care, chiar și atunci când creează imagini apropiate realității, nu coincide cu forma organică. Este ca un model liniar suprapus unei imagini și subordonându-se în sine. Există o nepotrivire, o denaturare, cifrele lui El Greco dau impresia de deformat, adesea incomod, mai ales în contururile picioarelor și brațelor. Însă frumusețea ideală nu a încântat pictorul și, într-o părtinire similară, precum și în încălcarea proporțiilor, a văzut una dintre expresiile spiritualului.
Linia continuă, care conturează figurile, de exemplu, în imaginea lui Hristos și a lui Ioan Botezătorul din imaginea menționată de la Madrid, devine, în cuvintele lui M. V. Alpatov, în lucrările lui El Greco „O formulă de ritm comprimat care pătrunde toate lucrurile vii, toată materia organică”.