Apărând religiei Bisericii Apostolice Armene, Aivazovsky a creat o serie de tablouri pe subiecte biblice, precum și subiecte istorice.
În 1862, Aivazovsky a scris două versiuni ale tabloului „Marele potop”, iar apoi în timpul vieții a revenit în mod repetat la această poveste biblică. Una din cele mai bune versiuni ale tabloului Marele Potop a fost scrisă de el în 1864.
Marea este cea care apare de obicei în el ca bază universală a naturii și istoriei, în special în parcele cu crearea lumii și cu potopul; cu toate acestea, imaginile religioase, biblice sau evanghelice, iconografie, precum și mitologia antică, nu pot fi considerate unul dintre cele mai mari succese ale sale.
Individualitatea creatoare și viziunea despre lume a marelui pictor marin, cu rădăcinile sale naționale, l-au legat de cultura armeană în timpul vieții sale. Muntele biblic Ararat – simbol al Armeniei – Aivazovsky a scris de cel puțin zece ori. El a expus pentru prima dată descendența lui Noe de la Ararat la Paris, iar când compatrioții săi l-au întrebat dacă are vreo specie armenească, i-a adus în imagine și a spus: „Iată Armenia noastră”.
Ulterior, Aivazovsky a prezentat pânza la școala Novakhichevan. În timpul războiului civil, școala a fost transformată într-o cazarmă, care a fost ocupată alternativ de alb și roșu. Imaginea acoperea golul din ușă. Odată ce decalajul a fost redus de către bord, iar poza a dispărut. Răpitorul era Martiros Sarian, care studiase cândva la această școală. În 1921, printre lucrările de artă armenească pe care le-a colectat, el a adus Pogorârea lui Noe la Erevan.
Printre tablourile cu un complot istoric se numără pictura Botezul poporului armean, care a împodobit la una dintre bisericile armate teodosiene și a stârnit sentimente patriotice în enoriași.
Complotul pentru imagine Botezul poporului armean a servit ca un moment de cotitură în istoria culturii armene. Înaltimea sa a fost facilitată de adoptarea creștinismului de către armeni. La începutul secolului al IV-lea, această religie a fost legalizată în Armenia ca religie de stat. Prin urmare, Armenia este astăzi unul dintre cele mai vechi state creștine.